طرحت في العقود الأخيرة – وتأثراً بالتطورات الفكرية والاجتماعية في الساحة الإسلامية – دراسات حديثة اتسمت بالجمع بين الجانب النظري والتطبيقي. ومن أبرز تلك الدراسات ما يتعلق بالنظرية السياسية في الاسلام، حيث تمثلت في الفقه الشيعي بنظرية ولاية الفقيه وتبلورت عملياً بعد استقرار نظام الجمهورية الاسلامية في إيران. حظت هذه النظرية باهتمام عديد من الدراسات والبحوث الفكرية لشرحها أو انتقادها في أسسها وتفاصيلها. ومن جملة البحوث القيمة في هذا المجال ما كتبه الأستاذ المحقق آية الله السيد محمد مهدي الموسوي الخلخالي تحت عنوان «الحاكمية في الإسلام» وشرح فيه تفاصيل نظرية ولاية الفقيه بأبعادها الواسعة والمتنوعة وانتقد الشبهات الدائرة حولها.