وی مسئول گروه روش های برنامه ریزی در سازمان برنامه و بودجه، سخنگوی کمیته علوم و پژوهش در جریان تهیه برنامه ششم ، معاونت برنامه ریزی، سازمان برنامه و بودجه، از ١٣٥٢ تا ١٣٥٦، بوده است. در کارنامه فعالیت های حرفه ای پرهام این موارد دیده می شود: استاد مدعو حقالتدریسی برای تدریس جامعه شناسی ِعمومی و مسائلی چون اصلاحاتِ ارضی و آثار و عوارض آن در دانشسرای عالی سپاه دانش، مدرسه عالی خدمات اجتماعی، دانشکده اقتصاد دانشگاه تهران، مدرسه علوم بانکی و دانشکده ادبیات دانشگاه تهران، از ١٣٤٦ تا ١٣٥٠. در ١٣٥٢، پیشنهاد استادیاری دکتر باقر پرهام در دانشکده علوم اجتماعی ِدانشگاه تهران با مخالفت ساواک منتفی شد و وی به دستور کتبی این سازمان از حضور و تدریس در کلیه دانشگاههای کشور محروم گردید
وی همچنین، معاون موسسه مطالعات و تحقیقات اجتماعی، تهران، پاییز ١٣٤٩، دستیار تحقیق در بخش مطالعات شهری، موسسه مطالعات و تحقیقات اجتماعی دانشگاه تهران، از تابستان١٣٤٣، دبیری دبیرستانها در کاشان به مدت پنج سال ازپاییز ١٣٣٨ تا خرداد ١٣٤٣ بوده است
از باقر پرهام این آثار تاکنون منتشر شده است: "جامعه و دولت"، نشر و پژوهش فرزان روز، تهران، ١٣٧٨، "با نگاه فردوسی: مبانی نقد خرد سیاسی در ایران"، نشر مرکز، تهران، ١٣٧٧ و"درباره روح انتقاد و انتقاد روح"، انتشارات آگاه، تهران، ١٣٦٤
برخی ترجمه های وی نیز عبارتند از: پدیدارشناسی جان، هگل، نشر آگاه (در دست انتشار). این ترجمه بر پایه ترجمه فرانسوی این اثر به کوشش ژان هیپولیت و تطبیق آن با دو ترجمه دیگر به فرانسه و دو ترجمه به انگلیسی و مقایسه اینها با متن اصلی به زبان آلمانی، صورت گرفته است. ناخشنودی آگاهی در فلسفه هگل، ژان وال، نشر آگاه، ١٣٨٧ و همچنین: اقتدار، ریچارد سنت، انتشارات شیرازه، ١٣٨٧
کتاب، واقعاً کتاب خوبی بود. نگارنده به شیوهای علمی تحقیق کرده و نوشته بود. نگاهی هم که به موضوع داشت، نگاهی بود که به نظرم باید به خیلی از متون کلاسیک فارسی داشت؛ تبیین نظام اندیشگی جامعۀ ایرانیان در طی تاریخ. مقالۀ اول درمورد تصحیح شاهنامه، واقعاً خوب بود. نحوۀ پیشنهادیِ تصحیحش به نظرم شیوهای است که با وجود معایب آن، باید بیشتر مورد توجّه مصحّحان قرار بگیرد.
به نظرم بر هر شاهنامهدوستی است که این طور آثار خوب را بخواند و این نحوۀ بررسی شاهنامه را ادامه دهد.
باقر پرهام پژوهشگری ست که کارهای ارزشمندی در زمینه فرهنگ ایران انجام داده. نگاه او در مجموعه ی مقالاتی که در این کتاب جمع آوری کرده؛ بررسی مبانی خرد سیاسی در شاهنامه، نوعی نگاه به متن شاهنامه و یکی دو اثر دیگر فارسی، به گونه ای ست که پیش از این معمول نبوده است. یکی از مقالات جالب این کتاب، تک نگاری در مورد سرانجام نبرد رستم و اسفندیار است، هم چنین مطلبی در مبانی و کارکردهای شهریاری در شاهنامه و...