أزمة التيارات الإسلامية المصرية كانت من قبل بداية الاحتجاجات التي انطلقت في مصر يوم 25 يناير2011 . فلم تكن الثورة فقط على النظام السياسي الغارق في الدكتاتورية والقهر والفساد بل كانت أيضا على المؤسسات الدينية لهذا النظام والخطاب الديني الداعم لاستمراريتهسواء كان دعما مباشرا تنتجه تيارات ومؤسسات وشخصيات مرتبطة بع ، أو كان دعما غير مباشر من فاعلين ينفصلون عن النظام لكن يلتقون معه في رفض الثورة.
- باحثا مشاركا في: • مركز الدراسات والوثائق الاقتصادية والقانونية والاجتماعية "سيداج" بالقاهرة (2011-2015) • برنامج WAFAW التابع للمجلس الأوروبي للبحوث European Research Council - فرنسا - مايو 2015.
الإنتاج العلمي:
- كتب منشورة:
1- الحالة السلفية المعاصرة في مصر – مكتبة مدبولي – طبعتان ( 2011، 2016)ز
2- الإسلاميون والثورة – دار أوراق للنشر – 2012ز
3- الدعوة السلفية السكندرية: مسارات التن/يم ومىلات السياسة - مركز دراسات الوحدة العربية 2016
- دراسات منشورة:
* "تحليل الدعاية الإنتخابية للسلفيين "، مجلة الديمقراطية ، عدد يناير 2012مز
* "توابع الثورة.. تجمعات سلفية جديدة"، مساهمة في كتاب: "السلفيون في مصر ما بعد الثورة "، مجموعة مؤلفين، مؤسسة الانتشار العربي ومركز الدين والسياسة للدراسات – بيروت 2012مز
* حزب النور وتداعيات ال 30 من يونيو، مجلة الديمقراطية - عدد أكتوبر 2013مز
* الإسلاميون في مصر: أزمات الفكر والتنظيم والسياسة ، مؤسسة مؤمنون بلا حدود يناير 2014.
*حالة التدين في مصر .. إلحاد إسلاميين نموذجًا ، (سلسلة مراصد ، مكتبة الإسكندرية ، عدد 27، ديسمبر 2014 ).
* خريطة الجماعات السلفية في مصر، (مجلة رؤى مصرية - مركز الأهرام للدراسات الاجتماعية والتاريخية، عدد 1 - فبراير 2015).
* Ahmad Zaghloul and Stéphane Lacroix, "Le salafisme révolutionnaire dans l'Egypte post-Moubarak" in Bernard Rougier, Stéphane Lacroix (eds.), L'Egypte en révolutions, Paris: Presses Universitaires de France, 2015.
* الأحزاب الإسلامية: تفاعلات مضطربة وتحديات مرحلية- مجلة رؤى مصرية ، مركز الأهرام للدراسات الاجتماعية والتاريخية، عدد 7 - أغسطس 2015.
* الإسلاميون والشريعة.. جدالات الديني والسياسي، مؤمنون بلا حدود، أكتوبر 2015.
* أين ذهبت أصوات الإسلامية؟، مجلة رؤى مصرية، مركز الأهرام للدراسات الاجتماعية والتاريخية، عدد 11، ديسمبر 2015.
* اقتصاديات الجمعيات الإسلامية في مصر: دراسة حالة، مؤمنون بلا حدود، أبريل 2016.
* واقع الإرهاب في مصر وأزمة مكافحته، مؤسسة فريدريش ايبرت - عمان، يونيه 2016.
* التيارات الإسلامية والأقباط: بين الفقهي والسياسي، مجلة رؤى مصرية، مركز الأهرام للدراسات الاجتماعية والتاريخية، عدد 17، يونيه 2016.
* النخب الدينية المصرية ممارسات الديني وتفاعلات السياسي،المركز العربي للأبحاث و دراسة السياسات- يوليو 2016
أوراق بحثية قدمت في مؤتمرات علمية:
* الدعوة السلفية بالإسكندرية بين المشايخية والحزبية " بالإشتراك مع د. عبد الفتاح ماضي، مركز مدى ومؤسسة قرطبة بجنيف، الدار البيضاء، المغرب، 1-2 مايو 2012م.
* "مستقبل التحولات داخل التيار السلفي في مصر "، ورقة مقدمة إلى: مؤتمر "التحولات السلفية": الدلالات، التداعيات والآفاق - مركز الدراسات الاستراتيجية بالجامعة الأردنية، بالتعاون مع مؤسسة فريدريش إيبرت الألمانية، 1 يوليه 2013م.
* الأقباط والإسلاميين إشكاليات الفكر والممارسة، ورقة مقدمة إلى: مؤتمر التعددية والتنوع الديني والثقافي في إطار الربيع العربي، مركز بيروت للأبحاث والابتكار، بيروت 5-7 نوفمبر 2013م.
* التنظيمات السلفية التشابه والاختلاف واستراتيجيات الانتشار، ورقة مقدمة إلى: ندوة فكرية بعنوان:" ظاهرة السلفية بين الفهم والتجاوز"، منتدى الجاحظ، تونس 30/31 مايو 2014.
* تأميم المجال الديني في مصر، ورقة مقدمة إلى مُؤتمر: بالإخوان أو دونهم: التيارات المحلية والإقليمية والدولية داخل الإسلاموية (2013-2015)، معهد العلوم السياسية، باريس، 29/30 أكتوبر 2015.
* اقتصاديات الجمعيات الإسلامية في مصر، دراسة حالة، ورقة مقدمة إلى مُؤتمر:اقتصاديات التدين في المنطقة العربية، مؤسسة مؤمنون بلا حدود، القاهرة ، 29 – 30 أبريل 2016.
* واقع الإرهاب في مصر وأزمة مكافحته، ورقة مقدمه إلى المؤتمر الإقليمي حول "وسائل منع ومكافحة الإرهاب في الشرق الأوسط وشمال أفريقيا والغرب"، مؤسسة فريدريش ايبرت في عمان، الأردن، 1 يونيه 2016.
* النخب الدينية المصرية ممارسات الديني وتفاعلات السياسي، ورقة مقدمة إلى الندوة الدولية بعنوان:"النخب والانتقال الديمقراطي،التشكل، المهام والأدوار، المركز العربي للأبحاث و دراسة السياسات- تونس، 16،15،14 يوليو 2016